Première base de données de variantes génomiques de la population vietnamienne

Vingroup Big Data Institute (VinBigData) a annoncé récemment qu'il avait achevé l’élaboration d’une base de données sur la variation génétique de la population vietnamienne.

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Données de la base de données des variantes génomiques de la population vietnamienne.

Avec plus de 1.000 génomes séquencés et plus de 40 millions de variantes découvertes, dont près de 2 millions étaient représentatives de la population vietnamienne, la recherche sur la base de données des variantes génomiques pour la population vietnamienne jettera les bases du développement de la médecine biomédicale et de précision, contribuant à donner un traitement précoce des maladies à chaque individu vietnamien à l'avenir.

Ce premier ensemble de données du génome vietnamien assure la représentativité et l'universalité de la population, et est cohérent avec la répartition géographique de la population (Nord : 37% ; Centre 22% ; Sud : 41%) et le sexe (ratio équilibré hommes/femmes). En particulier, l'ensemble des données génétiques est entièrement annoté sur la fonction biologique ainsi que sur le risque pathologique.

Lancé en décembre 2018, le projet a attiré la participation de plus de 40 scientifiques des principales universités et unités du monde entier, ainsi que des centaines d'experts et de bénévoles au pays et à l'étranger.

Le processus a été réalisé dans un laboratoire répondant aux normes ISO 15189 du Vinmec International General Hospital, en utilisant les technologies avancées de Google, Illumina et NVIDIA.

En outre, l'unité de recherche coopère avec une vingtaine d'organismes de recherche et d'hôpitaux nationaux et étrangers de premier plan, tels que l'Université John Hopkins (États-Unis), la Fondation GoldenHelix (Royaume-Uni), l'Université de médecine de Hanoï, l'Hôpital central militaire 108, etc.

Une partie de la base de données est désormais disponible sur genome.vinbigdata.org. Plusieurs outils d'analyse à haute vitesse sont également proposés à l'essai sur le site.

Ce projet est le premier à une telle échelle au Vietnam et coûte au total 4,5 millions d’USD.

Avec la prémisse d'en faire une base de données sur les variations génétiques exclusivement pour les Vietnamiens, l'étude devrait ouvrir une nouvelle direction, contribuant au développement de la médecine de précision au Vietnam.

Le Professeur Ta Thành Van, président du conseil de la Faculté de médecine de Hanoï, a déclaré que la base de données fournirait une référence inestimable pour améliorer l'efficacité du diagnostic et du traitement des maladies dans le pays.


Texte et photo : Thanh Minh/CVN

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